e:Med Projektgruppen – Umfrage 2021

 

Systemmedizin ist stets intensive, (Themen-)grenzen überschreitende Forschung. Um Austausch zu ermöglichen, Redundanzen zu vermeiden und Ressourcen zu schonen, bietet das e:Med Netzwerk eine effektive Möglichkeit zur Zusammenarbeit: Die e:Med Projektgruppen.

In e:Med Projektgruppen (PG) werden inhaltliche bzw. methodische Querschnittsthemen definiert professionell und auf die Systemmedizin bezogen bearbeitet. Die Ergebnisse, Workshops oder Summer Schools stehen allen e:Med Mitgliedern offen, wie auch alle e:Med Mitglieder und interessierte Wissenschaftler*innen Teil spezifischer Projektgruppen werden können.

In dieser Umfrage soll das Interesse der e:Med Community an den einzelnen Projektgruppen und Themen ermittelt werden, um dies bei der Organisation zu berücksichtigen. Zur Umfrage scrollen Sie bitte nach unten.

Übersicht geplanter Projektgruppen:

1. Datenmanagement & Bioinformatik

Kooperation zwischen Mathematikern, Bioinformatikern und medizinischen Informatikern. Fokus insbesondere auf Datenmanagement-Lösungen.

Aktivitäten: Workshops, Umfrage zu Tools, Daten und Fachwissen in e:Med, Publikation: Biomedical and Clinical Research Data Management

zukünftige Schwerpunkte: Meta-Daten für Omics-Experimente (als Grundlage für integrative Analysen)

 

2. Datensicherheit und Ethik

Umgang mit Datensicherheit, Datenzugriff und ethischen Aspekten in Bezug auf Patientendaten mit hohem Durchsatz, ePA, Patienten-Einverständniserklärung, Patientenpartizipation

Aktivitäten: Workshops, Online Umfragen, Zusammenarbeit mit TMF, Verbindung zu NFDI4Health

3. Bildverarbeitung

Bisher: Identifizieren einer Datenbank für Archivierung und Austausch unterschiedlicher Formate und Analysen, Anpassung an die Bedürfnisse der teilnehmenden Wissenschaftler

Aktivitäten: Summer School ConISyM 2019, Workshops

zukünftige Schwerpunkte: Neugestaltung der PG - Aspekte der Bilddaten, Bilddaten-Nutzung und – Analysetechniken (DeepLearning basierte Segmentierung, native 3D Bildanalyse,…), neue Mikroskopiertechniken (wie multiplexed immunofluorescence, spatially resolved transcriptomics, neue Lightsheet-Mikroskopieansätze), Vernetzung der entsprechenden Wissenschaftler, Aktivitäten: Summer School 2022, 1-tägige Workshops, Journal Club
Erweiterung durch Neuroimaging sharing network

 

 

4. Multiscale sequence-based analysis tools in Systems Medicine

ehemals Epigenetik & Sequenzierung + Einzelzell- & Multi-Omics

Erfahrungsaustausch in Sequenzierungsfragen und epigenetischen Analysen, technologische Lösungen, Liste der Tools und Fachkenntnisse

Aktivitäten: Workshops, Satellite Symposium, e:Med Summer School SEEDS 2017

Zukünftige Schwerpunkte: Thematische Erweiterung Einzelzell-Omics Ansätze in der Systemmedizin, Erfahrungsaustausch, gemeinsame einrichtungs- und institutionsübergreifende Zusammenarbeit etc., Workshop Single Cell Seq, Summer Schools, Webinare

 

5. MS-based Omics

Austausch von Omics-Infos (Proteomics, Lipidomics und Metabolomics), Tools, Ressourcen und Ideen zur Erfassung, Analyse und systemmedizinischen Integration von Massenspektrometrie (MS)-abgeleiteten Omics-Daten

Aktivitäten: 2019 LipoSysMed Summer School

zukünftige Schwerpunkte: Erweiterung auf NMR-Spektroskopiemessungen zur Metabolomics-Datenerhebung, Workshops, Subthemen: Lipidomics, Metabolomics, Proteomics

6. Modellierung von Krankheitsprozessen

Neue Projektgruppe:
Kooperation zwischen Modellierern &  Bioinformatikern für Verständnis und Modellierung der Heterogenität von Krankheitsmodellen. Entwicklung von Modellen der dynamischen Sicht auf Krankheitsprozesse, Abbildung der „Fehler“ der Systembiologie

zukünftige Schwerpunkte: Workshops, Erfahrungsaustausch

 

7. in vitro und in vivo Modellsysteme

Neue Projektgruppe:

Erfahrungs- / Austausch: Techniken, Protokolle/ Standards, Beispiele: Tiermodelle, Organoide, co-culture, lab-on-a-chip

Zukünftige Schwerpunkte: Kurse, Summer School, Laborvisiten, Unterstützung bei set-up/ troubleshooting

 

 


Haben Sie Interesse an einer oder mehreren Projektgruppen?

  • Interesse an Leitung (Organisation, Themenvorschläge, Ideen und Durchführung von Aktivitäten)
  • Interesse aktiv (Mitgestaltung von Workshops, Vorträgen, Mitarbeit an Publikationen)
  • Interesse passiv (Erhalt von Information über Aktivitäten der PG und Teilnahme an relevanten Workshops o.ä.)

Sie sind herzlich zur Beteiligung eingeladen. Tragen Sie sich bitte hierfür unverbindlich in das Formular ein. Hier können Sie Ihr voraussichtliche Beteiligung abstufen.

Ich möchte in den jeweiligen E-Mail-Verteiler aufgenommen werden und habe Interesse an folgenden Projektgruppen:

PG Umfrage 2021

PG Umfrage

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